Kegiatan kerohanian merupakan salah satu kegiatan tetap di SMP Negeri 3 Sidoarjo. Selain dapat menumbuhkan hubungan yang baik antara siswa dengan Sang Pencipta melalui kegiatan keagamaan bersama, kegiatan ini juga merupakan salah satu bentuk realisasi dari visi SMP Negeri 3 Sidoarjo itu sendiri, yaitu “Berprestasi Tinggi, Berbudi Pekerti Luhur, dan Berwawasan Lingkungan”.
Kegiatan kerohanian dilaksanakan dengan cara beragam. Semua siswa, dimulai dari kelas 7 hingga kelas 9 wajib mengikuti kegiatan ini. Kegiatan ini dilaksanakan sesuai dengan agama para siswa masing-masing. Kegiatan kerohanian yang sering dilakukan bagi siswa yang beragama Islam, antara lain :
1. Shalat Berjamaah
2. Shalat Idul Adha berjamaah
3. Takbiran menjelang Idul Adha
4. Pondok Ramadhan
5. Istighasah menjelang Ujian Nasional
Kegiatan kerohanian ini dimasukkan pada program pengembangan diri setiap hari Jum’at, dan ini diperuntukkan bagi siswa kelas 7 dan 8. Untuk siswa kelas 9 yang menjelang Ujian Nasional, setiap Jum'at pagi sekolah diadakan acara do’a bersama (istighasah) menjelang Ujian Nasional. Setiap ada perayaan hari besar Islam, SMP Negeri 3 Sidoarjo-pun tetap mengadakan acara, seperti acara penyembelihan hewan kurban di hari Raya Idul Adha, Shalat Idul Adha berjamaah di sekolah, ceramah agama pada saat perayaan Maulid Nabi, dan lain sebagainya.
Tujuan utama dari penyelenggaraan acara ini adalah untuk meningkatkan keimanan dan ketaqwaan siswa-siswi ditengah cepatnya arus globalisasi ini. Selain itu, lewat acara ini SMP Negeri 3 Sidoarjo juga berusaha untuk menambah pengetahuan siswa-siswi mengenai khazanah keislaman. Menurut saya, kegiatan ini sangat penting dan harus dilakukan secara rutin. Diharapkan, melalui kegiatan kerohanian di SMP Negeri 3 Sidoarjo ini, seluruh siswa bisa menjadi siswa yang berakhlak mulia, memiliki keimanan yang kuat, serta cerdas dalam menyikapi berbagai hal yang datang di era ini sesuai dengan agama dan kepercayaannya masing-masing.
